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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
南宁动物园网红黑猩猩“暴走”系游客挑衅所致******
中新网南宁10月13日电(俞靖)南宁市动物园13日就该园区动物因“活泼”行为走红网络回应称，部分游客为观看“走红黑猩猩”抛物，存在向动物挑衅、起哄等不文明行为，园方呼吁游客文明游览。
近日，南宁市动物园部分动物因“活泼”行为爆火网络。某短视频平台上频现黑猩猩抛物、黑熊蹭下腹部、环尾狐猴佛系晒太阳等视频。不少短视频制作者以拍摄各类动物的“迷惑行为”吸引眼球，受到民众广泛关注。
南宁动物园相关工作人员表示，短视频中所出现的黑猩猩抛物、黑熊扭屁股、河马排粪、长臂猿翻跟斗等动物行为，可以从动物习性、生理行为、领地意识等方面分析，大多数属于正常的动物行为。如环尾狐猴晒太阳，是因环尾狐猴生活在非洲马达加斯加的疏林裸岩地带，日晒时间较长，它喜欢摊开四肢，正面朝着太阳，让阳光洒满躯干，驱赶夜里的寒气，因此人们把它称作“太阳崇拜者”，属于自然行为。
经了解，南宁动物园未来将优化动物饲养、生活环境，并完善科普设施设备，满足游客对动物行为的好奇。同时园方呼吁游客，在游园过程中请勿挑衅动物，为它们创造安静、舒适的环境。(完)
（文图：赵筱尘 巫邓炎） [责编：天天中] 阅读剩余全文（）  视觉焦点
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